A PUC Minas, no contexto das universidades não públicas, se destaca tanto no investimento em pesquisa quanto na diversidade de programas de pós-graduação. Os programas são todos recomendados pela Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).
A alta produção científica, em número e qualidade dos veículos de publicação, tem se constituído em importante indicador da pós-graduação da PUC Minas, que tem registrado mais de 360 dissertações e teses defendidas por ano.